Descripción general

El servicio de secuenciación de nueva generación permite obtener información de la secuencia completa del genoma ADN o transcriptoma (RNA) de especies animales, vegetales o microorganismos (virus, bacterias y hongos), con el fin de identificar las bases genéticas que controlan diferentes características de interés agropecuario. Este análisis se realiza a partir de la remisión de muestras de ADN o RNA provenientes de tejido animal (sangre, semen, músculo o pelo), tejido vegetal (semilla, hoja, raíz, fruto) o cultivos microbiológicos (cajas de Petri con los cultivos). El servicio incluye la evaluación de la calidad e integridad del ADN o del RNA, por medio de métodos de espectrofotometría (nanodrop), fluorometría (Qubit), electroforesis en geles de agarosa y evaluación en el tape Station (DIN o RIN), dilución del material genético, preparación de librerías genómicas, cuantificación y evaluación del tamaño, la concentración de las librerías genómicas (por medio de equipos como el qubit y el tape station) y la secuenciación (teniendo en cuenta la cobertura, profundidad, número de lecturas y tamaño del genoma) en el equipo secuenciador HiScan, módulo SQ de la marca Illumina®. El formato en el que se procesa la información puede ser en un solo sentido (single read) o en doble sentido (paired end), según la profundidad y cobertura que el cliente requiera.